Спиридонова Л.Н., Вальчук О.П., Редькин Я.А.
В журнале Генетика
Год: 2024 Том: 60 Номер: 7 Страницы: 45-61
Проведено секвенирование частичного фрагмента генов ND5-cytb митохондриального генома (1553 пн) и его ядерных копий Phylloscopus borealis sensu lato (s. l.), принадлежащих к отдельным таксономическим группам из разных частей ареала. Показана идентичность большинства таксон-специфичных и уникальных митохондриальных замен у форм examinandus и xanthodryas с таковыми в ядерных копиях мтДНК borealis. Различия митохондриальных гаплотипов examinandus с ядерными копиями мтДНК borealis имели низкие значения (p = 0.02), а генетическая дивергенция собственно мтДНК borealis-examinandus, borealis-xanthodryas и examinandus-xanthodryas значительно превышала предыдущие значения (p = 0.035, 0.044 и 0.046 соответственно). Впервые в ядерном геноме одной особи borealis в западной части гнездового ареала (Республика Коми) обнаружена ядерная копия митохондриального гаплотипа самой восточной формы xanthodryas, а ядерные копии мтДНК xanthodryas из префектуры Тояма (Япония) оказались, в свою очередь, близки митохондриальным гаплотипам borealis из Кытлыма (Свердловская обл.) (p = 0.018). Таким образом, источником большинства замен в митохондриальных ДНК исследованных форм являются мутации, возникшие в ядерных копиях митохондриальных генов. Происхождение митохондриальных гаплотипов examinandus и xanthodryas из ядерных копий мтДНК borealis и близкое сходство их ядерных геномов дают основание рассматривать митогеномы этих форм в качестве вариантов гаплотипа одного вида Ph. borealis s. l. С большой долей вероятности можно утверждать, что время дивергенции гаплотипов анализируемых форм значительно меньше, чем 2.5-3 млн лет, как то предполагалось рядом авторов ранее, а “молекулярные часы”, не учитывающие рекомбинационные события между ядерным и митохондриальным геномами, в данном случае не могут быть использованы.