Ядерные копии митохондриальных генов – источник новых гаплотипов гена цитохрома b мтднк Luscinia calliope (Muscicapidae, Aves)

Спиридонова Л.Н., Вальчук О.П., Редькин Я.А., Крюков А.П

В журнале Генетика

Год: 2016 Том: 52 Номер: 9 Страницы: 1069–1080

Проанализирован полиморфизм нуклеотидных последовательностей участка гена цитохрома b митохондриальной ДНК у 21 образца подвида Luscinia calliope calliope (Pallas, 1776) и двух образцов L. c. anadyrensis (Portenko, 1939). На сиквенсных хроматограммах у 19 образцов L. c. calliope выявлены двойные пики в таксон-специфичных позициях по типу гетероплазмии. При этом обнаружено два варианта клонов: первый – митохондриальный ген cyt b calliope, второй – ядерный псевдоген cyt b, сходный с митохондриальным гаплотипом anadyrensis–camtschatkensis. У L. c. anadyrensis обнаружено четыре варианта клонов: митохондриальные гены cyt b calliope и anadyrensis–camtschatkensis и ядерные псевдогены cyt b calliope и sachalinensis. Некоторые ядерные копии гена cyt b имеют высокое сходство (98–99%) с митохондриальными генами подвидов L. c. anadyrensis, L. c. camtschatkensis и L. c. sachalinensis. Однако большинство последовательностей ядерных псевдогенов имеют высокий уровень полиморфизма, обусловленный несинонимичными заменами (до пяти замен на одну последовательность), присутствием в некоторых клонах инделей, TAA и TGA стоп-кодонов. Митохондриальные гаплотипы anadyrensis–camtschatkensis и sachalinensis произошли, по нашему мнению, в результате межгеномной гомологичной рекомбинации. Это позволяет по-новому представить историю заселения L. calliope северо-восточной части ареала, согласно которой последовательное освоение территорий Чукотки–Камчатки и Сахалина шло в разное время и независимыми путями.

DOI 10.7868/S0016675816090137

Полный текст