Молекулярная биология морского ежа: примеры успешного сотрудничества ИБМ ДВО РАН и БПИ ДВО РАН

Киселев К.В.

В издании Третьи чтения памяти академика В.Л. Касьянова

Год: 2014 Страницы: 5

Морские ежи из-за ряда особенностей уже давно представляют особый интерес для ученых со всего мира, особенно для эмбриологов (легко доступный эмбриональный материал). Благодаря секвенированию полного генома морского ежа Strongylocentrotus purpuratus в 2006 году морские ежи стали удобным объектом для проведения молекулярно-биологических исследований. Накопленный определенный экспериментальный опыт и интересный объект исследований в итоге привели к более чем 10 летнему сотрудничеству между сотрудниками ИБМ ДВО РАН и БПИ ДВО РАН. Результатом стало открытие возможности агробактериальной трансформации морских ежей. Было показано, что биосинтез ценных пигментов морских ежей зависит от содержания предшественников их биосинтеза и экспрессии поликетид синтазы (pks). Более того, добавление патогенных бактерий к эмбрионам морских ежей сопровождалось достоверным увеличением экспрессии гена pks и содержанием нафтохиноновых пигментов. Эти результаты нашли отражение в виде нескольких статей в высоко рейтинговых изданиях. В докладе будут рассмотрены основные современные методы молекулярной биологии, используемые в БПИ ДВО РАН: получение новых генетических конструкций, выделение ДНК/РНК, получение кДНК, геноспецифический ПЦР, клонирование, секвенирование, ПЦР с детекцией результатов в реальном времени. Более того, важным будет обсудить возможность применения ряда новых методов, осваиваемых нашим коллективом для решения фундаментальных целей молекулярной биологии развития морских ежей.