2019
Из почв Дальневосточного региона России (Сахалин, Якутия, Еврейская автономная область, Амурская область, Магадан, о. Итуруп, Камчатка) выделены 70 психротрофных изолятов микроорганизмов. В результате скрининга выделенных изолятов на наличие ферментативной активности (амилазной, протеазной и липазной) установлено, что всеми тремя активностями обладают три изолята, выделенные из почв о. Итуруп и Якутии. Две из трех активностей показали 16 изолятов. Таким образом, наиболее перспективными являются 19 изолятов, которые были введены в коллекцию для дальнейшего изучения и идентифицированы по гену 16S рРНК: Agrococcus baldri, Bacillus safensis, Carnobacterium inhibens, Escherichia fergusonii, Kocuria carniphila, Kocuria rosea, Pseudomonas japonica, Pseudomonas stutzeri, Serratia liquefaciens Staphylococcus lentus, Staphylococcus pasteuri, Staphylococcus xylosus. Эти 19 штаммов также были подвергнуты расширенному скринингу на активность внеклеточных ферментов (целлюлаза, ксиланаза, пектиназа, амилаза и протеаза) с помощью высокопроизводительного метода на основе планшетов. Установлено, что один штамм (Bacillus sp.) способен продуцировать несколько полезных ферментов: эндоглюканазу, амилазу, ксиланазу, пектиназу и протеазу. Последовательность его генома была определена как полный размер генома 6,4 Mbp, включая 5,6 Mbp хромосомы и 3 плазмиды. Экзопротеом, секретируемый этим штаммом, будет сфокусирован и дополнительно охарактеризован для потенциальных ферментов, применяемых в промышленности.
