Тандемные повторы геномов мышевидных грызунов в базах данных и их картирование

Остромышенский Д.И., Кузнецова И.С., Комиссаров А.С., Картавцева И.В., Подгорная О.И.

В журнале Цитология

Год: 2015 Том: 57 Номер: 2 Страницы: 102-110

Тандемно-повторяющиеся последовательности представляют собой уникальный для эукариот класс ДНК. Их содержание в геноме у высших эукариот может достигать десятков процентов. Однако вопросы эволюции этого класса последовательностей остаются малоисследованными. Ранее методами биоинформатики выявлены 62 семейства тандемных повторов (ТП) Mus musculus; в настоящей работе 7 из них картировано на метафазных пластинах с помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH). Те же пробы использовали для двух других видов рода Mus - M. caroli и M. spicilegus. Показано, что наборы ТП совпадают только у близкородственных видов мышей. Но даже у таких видов наблюдаются различия в локализации на хромосомах и интенсивности метки отдельных ТП. Только отдельные семейства ТП остаются общими при увеличении эволюционного расстояния между видами. Применение сочетания биоинформатических и молекулярно-биологических методов для исследования эволюции ТП перспективно, но пока ограничено наличием прочитанных геномов близких видов.

Полный текст