Шедько Сергей Владимирович. Составляющие успеха молекулярной филогенетики Наблюдающийся в последнее время постоянный рост числа работ, посвященных исследованиям филогении организмов на основе анализа нуклеотидных или аминокислотных последовательностей, может быть объяснен рядом преимуществ молекулярной филогенетики перед традиционной (морфологической). Относительной простотой, объективностью и воспроизводимостью процесса выделения филогенетических признаков и установления их состояний (модальностей) в молекулярной филогенетике. Принципиальной аддитивностью (слагаемостью) первичных данных, полученных в независимых исследовательских лабораториях для одних и тех же или разных объектов по гомологичным участкам генома (= филогенетическим маркерам). Высокой информативностью молекулярных маркеров для решения вопросов филогении в принципе и возможностью привлечения больших массивов данных (в случае необходимости - сотни тысяч филогенетических признаков). Возможностью разработки схем филогений с учетом известных закономерностей изменчивости филогенетических маркеров в ходе эволюции (использование вероятностных моделей эволюции последовательностей). Возможностью привязки кладогенетических событий к абсолютной временной шкале. Динамичным развитием инфраструктуры (техника, биоинформатика, интернет-базы данных, образование и пр.). Важные литературные источники: Банникова А.А. (2004) Молекулярные маркеры и современная филогенетика млекопитающих // Журнал Общей биологии. т. 65, № 4, с. 278-305. PDF Madsen O., Scally M., Douady C.J., Kao D.J., DeBry R.W., Adkins R., Amrina H.M., Stanhope M.J., De Jong W.W., Springer M.S. (2001) Parallel adaptive radiations in two major clades of placental mammals // Nature. V. 409. P. 610-614. PDF Murphy W.J., Eizirik E., O`Brien S.J., Madsen O., Scally M., Douady C.J., Teeling E., Ryder O.A., Stanhope M.J., De Jong W.W., Springer M.S. (2001) Resolution of the early placental mammal radiation using Bayesian phylogenetics // Science. V. 294. P. 2348-2351. PDF Nikolaev, S., J. I. Montoya-Burgos, E. H. Margulies, N. C. Program, J. Rougemont, B. Nyffeler, and S. E. Antonarakis (2007) Early history of mammals is elucidated with the ENCODE multiple species sequencing data. PLoS Genetics 3:e2. PDF Springer MS, Stanhope MJ, Madsen O, De Jong WW (2004) Molecules consolidate the placental mammal tree. Trends Ecol Evol 19: 430-438. PDF The AToL initiative (Assembling the Tree of Life) Whelan S, Li? P, Goldman N. (2001) Molecular phylogenetics: state-of-the-art methods for looking into the past // Trends Genet. 17(5):262-72.