Проблемы ботаники и интродукции растений

Проведена полная ревизия флоры полуострова Муравьева-Амурского.

"Методические указания по выделению особо защитных участков леса в местах обитания и распространения редких и охраняемых видов животных и растений, а также ценных промысловых животных в лесах юга Дальнего Востока" разработаны в качестве дополнения к существующим нормативам по выделению особо защитных участков леса и направлены на совершенствование системы выделения, закрепления и определение режима пользования в местах обитания и распространения редких и охраняемых видов животных и растений, а также ценных промысловых животных в лесах юга Дальнего Востока.

Палеобиология и эволюция органического мира

С привлечением данных палеоксилологии прослежена смена древесной растительности в неогене на территории Дальнего Востока, установлена ее тесная сопряженность с изменением климатических условий.

Проблемы животного мира

Обобщены результаты многолетних исследований по систематике и биологии двукрылых насекомых Дальнего Востока России (1140 видов). Составлен каталог 850 видов бабочек-совок азиатской части России и Урала. (Определитель насекомых Дальнего Востока России. Т. 6. Двукрылые и блохи. Ч. 4. Владивосток: Дальнаука, 2006. 936 с. Kononenko V.S. An annotated Check list of the Noctuidae (s. l.) (Lepidoptera, Noсtuoidea: Nolidae. Erebidae. Micronoctuidae, Noctuidae) of the Asian part of Russia and the Ural region. Noctuidae Sibiricae. Soro, 2005.Vol. 1, 243 pp.)

Гидробиология и ихтиология

Собрана мировая база данных водорослей-индикаторов, включающая 6900 видов. Сведены в систему представления о структурном разнообразии водорослевых сообществ. На этой основе разработана эмпирическая модель функционирования водной экосистемы, выделены критические уровни развития. Разработаны оригинальные индексы и система экологического картографирования водоемов на бассейновой основе. (Биоразнообразие водорослей-индикаторов окружающей среды. Изд-во Pilies Studio, Тель-Авив, 2006. 498 с. 25 п.л. (авторы: Баринова С.С., Л.А. Медведева, Анисимова О.В.).